Рефлексотерапия работает путём воздействия на биологически активные точки на теле. Воздействие на них генерирует импульсы, которые поступают в различные отделы головного мозга и запускают процесс самовосстановления поражённого органа или ткани.
На нейрохимическом (центральном) уровне рефлексотерапия повышает активность тормозных медиаторов (глицина и глутамина), увеличивает уровень серотонина и нормализует вегетативный статус, влияя на различные системы ствола мозга. Таким образом корректируются эмоциональные реакции, повышается болевой порог.